Rollen til guanidinhydroklorid i proteindenaturering

Proteiner er mer utsatt for ytre faktorer (temperatur, denaturanter, etc.) for å gjennomgå konformasjonsendringer, noe som fører til tap av aktivitet og unormale endringer i fysiske og kjemiske egenskaper. Denne prosessen kalles proteindenaturering.Guanidinhydroklorider en viktig denaturant, som kan gi en sterk denaturerende effekt, som inkluderer to denatureringsmekanismer.

Den ene er solubiliseringseffekten avguanidinhydrokloridpå hydrofobe aminosyrerester. Guanidinhydroklorid kan bryte hydrogenbindinger i proteinstrukturen, noe som øker løseligheten av ikke-polare molekyler inkludert aminosyresidekjeder og reduserer hydrofobe interaksjoner; en annen mekanisme er at denaturerte proteiner fortrinnsvis kan binde seg med guanidinhydroklorid for å danne denaturerte proteiner -Denatureringskompleks. Når komplekset er fjernet, skifter reaksjonsbalansen til høyre, og proteinet i sin naturlige tilstand transformeres kontinuerlig til et kompleks, noe som til slutt fører til fullstendig denaturering av proteinet. Imidlertid er bindingen av denatureringsmidler til denaturerte proteiner svært svak, og bare høye konsentrasjoner av denatureringsmidler kan forårsake fullstendig denaturering av proteiner. Generelt er denaturering forårsaket av guanidinhydroklorid vanligvis reversibel.